中国科学院水生生物研究所的研究团队通过长达20年的系统分析，发现长江干流6个淡水保护区内的江豚种群下降速度比非保护区快64.7%，且同样面临栖息地丧失、退化及人为干扰问题。研究指出，许多淡水保护区的成效不明显，甚至沦为“纸上保护区”。同时，栖息地质量对江豚生存至关重要，优质栖息地中江豚种群稳定或增长。

此外，研究建议在《长江保护法》框架下，优先保护非保护区内未经干扰的关键生境，并推动科学划定和保护关键栖息地。严格执法和积极的生态修复措施对江豚种群恢复有积极作用，该研究为长江流域和淡水生态系统保护提供了新思路。